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光波杀菌和微波杀菌都是有效的杀菌方式，它们各有优缺点，具体哪个更好要根据具体情况和需求来判断，光波杀菌与高温杀菌也存在一定的关联。
1、微波杀菌：微波杀菌主要是利用电磁场的热效应和非热效应来杀死细菌，这种方式可以深入物品内部，对物品进行全方位的杀菌，且不会对物品造成损伤，微波杀菌的能效高、时间短，适用于多种物品的杀菌。
2、光波杀菌：光波杀菌主要利用光波的特殊性质来杀死细菌，这种方式对物品的破坏较小，但可能不如微波杀菌那样深入彻底，光波杀菌还可以结合高温来进行，高温可以加速光波杀菌的速度和效果。
至于哪个更好，如果是对食品等物品的杀菌，微波杀菌可能更为常见和有效；而对于某些特定物品，如医疗器械等，可能光波杀菌更为适合，不过，具体的选择还需要根据物品的性质、杀菌需求以及实际情况进行综合考虑。
两种杀菌方式都有各自的优点，无法简单地判断哪个更好，而高温杀菌则是通过高温来杀死细菌，是食品加工业中常见的杀菌方式之一，与光波杀菌可以结合使用，提高杀菌效果。